西南大学百余年建校史中，经过全体西大人的不懈努力，西南大学已建成历史博物馆、美术馆、自然博物馆、植物标本馆、昆虫馆、柑桔馆、动物科学国家级实验教学示范中心（西南大学）标本馆等多个专业馆，服务于教学科研及文化展示。

为有效发挥高校博物馆在教学科研、文化育人等方面的功能，学校整合校内各专业馆资源，2014年在北碚校区建成中心馆——西南大学博物馆，建筑面积21185平方米，馆内设有基本陈列厅、临时展厅、专题展厅、阳光大厅以及配套的公共教育区和服务区。现有藏品一万余件，品类包括石器、陶器、玉器、瓷器、青铜器、钱币、书画、织绣、动植物标本等。藏品多来自历史文化学院 民族学院、美术学院、 植物保护学院、园艺园林学院、生命科学学院、蚕桑纺织与生物质科学学院以及柑桔研究所等多单位所属专业馆自上世纪50年代以来的历年收藏。2026年4月，博物馆已重新布展历史馆、民族馆、美术馆、自然馆基本陈列展览并面向公众免费开放，校庆期间已累计接待社会各界观众共1.5万余人次。

历史馆、民族馆依托历史博物馆建立，历史博物馆始建于1956年，其前身为西南师范学院历史系文物陈列室，现有藏品8000余件（套）；美术馆其前身为1997年成立的西南大学美术馆，现有藏品1000余件；自然馆始建于1953年的原西南师范大学自然博物馆，曾被评为全国科普教育基地，原馆位于生命科学学院内，由我国著名植物分类学家方文培教授于1951年建立，昆虫馆始建于1950年全国大专院校调整时，包括了来自四川大学、西昌技专和贵州大学的标本。

除基本陈列展览外，博物馆每年不定期举办临时展览、专题展览十余次，接待人数近三万人次。